Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC15Q0P6D6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC15Q0P6D6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms