Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RUNX1T1Q06455 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RUNX1T1Q06455 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1T1Q06455 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1T1Q06455 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1T1Q06455 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1T1Q06455 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1T1Q06455 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1T1Q06455 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1T1Q06455 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1T1Q06455 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RUNX1T1Q06455 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms