Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC18A2Q05940 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC18A2Q05940 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms