Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TAP1Q03518 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TAP1Q03518 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms