Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DSG1Q02413 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG1Q02413 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms