Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRX4P78413 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IRX4P78413 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IRX4P78413 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX4P78413 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX4P78413 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX4P78413 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX4P78413 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX4P78413 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX4P78413 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRX4P78413 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRX4P78413 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms