Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRX6P78412 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRX6P78412 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX6P78412 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX6P78412 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX6P78412 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX6P78412 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX6P78412 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX6P78412 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IRX6P78412 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IRX6P78412 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IRX6P78412 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IRX6P78412 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IRX6P78412 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX6P78412 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX6P78412 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX6P78412 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX6P78412 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX6P78412 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRX6P78412 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRX6P78412 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRX6P78412 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRX6P78412 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRX6P78412 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms