Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPL39P62891 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P62891 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P62891 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P62891 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P62891 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPL39P62891 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPL39P62891 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPL39P62891 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPL39P62891 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms