Protein–RNA interactions for Protein: P61925

PKIA, cAMP-dependent protein kinase inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKIAP61925 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKIAP61925 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKIAP61925 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKIAP61925 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKIAP61925 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKIAP61925 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKIAP61925 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKIAP61925 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKIAP61925 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKIAP61925 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKIAP61925 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKIAP61925 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PKIAP61925 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PKIAP61925 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PKIAP61925 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKIAP61925 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PKIAP61925 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms