Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBE2D3P61077 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2D3P61077 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms