Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEFA3P59666 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DEFA3P59666 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms