Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTF2A1P52655 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1P52655 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1P52655 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1P52655 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1P52655 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTF2A1P52655 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GTF2A1P52655 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GTF2A1P52655 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms