Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD8P48556 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms