Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ETV4P43268 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ETV4P43268 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ETV4P43268 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ETV4P43268 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ETV4P43268 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ETV4P43268 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV4P43268 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV4P43268 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV4P43268 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV4P43268 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ETV4P43268 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms