Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUP62P37198 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NUP62P37198 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP62P37198 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP62P37198 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NUP62P37198 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NUP62P37198 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NUP62P37198 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NUP62P37198 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP62P37198 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms