Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCK1P35558 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCK1P35558 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCK1P35558 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK1P35558 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK1P35558 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK1P35558 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK1P35558 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK1P35558 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PCK1P35558 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK1P35558 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms