Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GPC1P35052 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GPC1P35052 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPC1P35052 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPC1P35052 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPC1P35052 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GPC1P35052 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GPC1P35052 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GPC1P35052 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GPC1P35052 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GPC1P35052 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms