Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT15P19012 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT15P19012 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT15P19012 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT15P19012 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT15P19012 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT15P19012 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT15P19012 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT15P19012 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT15P19012 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT15P19012 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT15P19012 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRT15P19012 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRT15P19012 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRT15P19012 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRT15P19012 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRT15P19012 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRT15P19012 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms