Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT13P13646 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT13P13646 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT13P13646 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT13P13646 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT13P13646 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
KRT13P13646 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KRT13P13646 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KRT13P13646 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRT13P13646 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRT13P13646 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KRT13P13646 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KRT13P13646 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT13P13646 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms