Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GZMBP10144 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GZMBP10144 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GZMBP10144 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GZMBP10144 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GZMBP10144 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GZMBP10144 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GZMBP10144 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GZMBP10144 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GZMBP10144 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GZMBP10144 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GZMBP10144 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms