Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI3P10071 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI3P10071 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI3P10071 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI3P10071 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GLI3P10071 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GLI3P10071 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI3P10071 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI3P10071 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI3P10071 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI3P10071 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GLI3P10071 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GLI3P10071 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI3P10071 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI3P10071 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI3P10071 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI3P10071 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI3P10071 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI3P10071 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI3P10071 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GLI3P10071 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GLI3P10071 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GLI3P10071 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GLI3P10071 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI3P10071 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI3P10071 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI3P10071 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI3P10071 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GLI3P10071 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI3P10071 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI3P10071 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GLI3P10071 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GLI3P10071 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms