Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTA3P0C7M3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms