Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB5P09067 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXB5P09067 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms