Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TPM2P07951 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TPM2P07951 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPM2P07951 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPM2P07951 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPM2P07951 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPM2P07951 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPM2P07951 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPM2P07951 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TPM2P07951 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM2P07951 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM2P07951 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM2P07951 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM2P07951 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM2P07951 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM2P07951 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TPM2P07951 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TPM2P07951 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TPM2P07951 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TPM2P07951 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM2P07951 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM2P07951 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM2P07951 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM2P07951 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM2P07951 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM2P07951 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM2P07951 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM2P07951 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TPM2P07951 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM2P07951 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM2P07951 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM2P07951 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM2P07951 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM2P07951 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TPM2P07951 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TPM2P07951 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms