Protein–RNA interactions for Protein: P00450

CP, Ceruloplasmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPP00450 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CPP00450 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CPP00450 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPP00450 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPP00450 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPP00450 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPP00450 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPP00450 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPP00450 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPP00450 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPP00450 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CPP00450 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPP00450 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CPP00450 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPP00450 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPP00450 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPP00450 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPP00450 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPP00450 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPP00450 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPP00450 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPP00450 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPP00450 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPP00450 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms