Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
KDM6BO15054 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KDM6BO15054 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KDM6BO15054 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms