Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC27A2O14975 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A2O14975 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms