Protein–RNA interactions for Protein: O00220

TNFRSF10A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10A, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10AO00220 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFRSF10AO00220 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10AO00220 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms