Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPSO00116 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPSO00116 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPSO00116 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPSO00116 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPSO00116 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AGPSO00116 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AGPSO00116 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AGPSO00116 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGPSO00116 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGPSO00116 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AGPSO00116 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPSO00116 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPSO00116 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPSO00116 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPSO00116 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPSO00116 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AGPSO00116 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AGPSO00116 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPSO00116 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPSO00116 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPSO00116 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AGPSO00116 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AGPSO00116 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AGPSO00116 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms