Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 HLA-DRB6-202ENST00000437183 1090 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 SMUG1-213ENST00000506595 712 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC005355.1-201ENST00000513329 714 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 MEG8_1.1-201ENST00000617245 97 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 HSD3B2-201ENST00000369416 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC245884.11-201ENST00000616950 1734 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 UBA3-202ENST00000361055 2154 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 DRC1-201ENST00000288710 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PLXDC1-206ENST00000444911 2082 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 IL16-203ENST00000394652 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CPT1B-203ENST00000395650 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC139099.1-202ENST00000574098 2409 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 GMPR2-202ENST00000355299 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ACIN1-213ENST00000555053 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 MMP2-202ENST00000437642 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PHACTR3-203ENST00000361300 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 LINC00473-204ENST00000584179 1717 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ZNF567-202ENST00000536254 2825 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 GSTM5-201ENST00000256593 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CD209-201ENST00000204801 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 NUBP1-201ENST00000283027 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CD209-202ENST00000315591 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC092587.1-201ENST00000410042 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ATXN8OS-201ENST00000414504 1148 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 SNCA-208ENST00000505199 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AL133297.2-201ENST00000563162 485 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC074052.1-201ENST00000567734 456 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AL391669.1-201ENST00000619829 285 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 LAMTOR5-AS1-234ENST00000625584 508 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AC003991.1-211ENST00000631117 870 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 GRAMD1B-201ENST00000322282 2571 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 MAMLD1-205ENST00000432680 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PRAMEF12-201ENST00000357726 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CSF2RA-208ENST00000417535 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 OAS1-203ENST00000452357 1990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 ENO4-203ENST00000409522 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 KDM4E-201ENST00000450979 2339 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 RNF13-203ENST00000392894 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 PIK3R3-204ENST00000423209 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CASP7-210ENST00000614447 2555 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 AKT2-201ENST00000311278 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 CETN3-201ENST00000283122 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO3Q8TAP4 FGD3-202ENST00000375482 3321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO3Q8TAP4 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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