Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SCN2BO60939 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 ENOX2-201ENST00000338144 4263 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 TTYH2-201ENST00000269346 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 MFAP4-201ENST00000299610 1873 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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SCN2BO60939 MFAP4-203ENST00000497081 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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SCN2BO60939 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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SCN2BO60939 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 PES1P1-201ENST00000508165 1736 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 DDR1-226ENST00000376569 3783 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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SCN2BO60939 AP001150.1-201ENST00000558822 2128 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SCN2BO60939 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SCN2BO60939 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SCN2BO60939 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SCN2BO60939 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 FAM47A-202ENST00000613251 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 LBP-201ENST00000217407 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SCN2BO60939 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 SERPINH1-202ENST00000524558 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 THAP1-201ENST00000254250 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SCN2BO60939 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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