Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 BANK1-201ENST00000322953 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SIGLEC17P-204ENST00000618545 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BAHD1-202ENST00000560846 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MMP2-202ENST00000437642 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SALL4P1-201ENST00000510352 1860 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SETDB2-203ENST00000354234 6139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CLCN6-206ENST00000376496 2922 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CIITA-212ENST00000618207 2844 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 OR4X1-201ENST00000320048 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RPS19P3-201ENST00000480487 441 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC008676.2-201ENST00000519499 741 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PTPN6-201ENST00000318974 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DEPDC1-201ENST00000370966 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC079779.1-201ENST00000437798 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 COL20A1-201ENST00000358894 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FBXO34-202ENST00000440021 2831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MRVI1-214ENST00000534266 2824 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 IL10RA-201ENST00000227752 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SLC22A12-204ENST00000377574 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AP5S1-205ENST00000615891 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 OSBPL9-207ENST00000462759 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 TACC2-201ENST00000260733 3644 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 LPGAT1-202ENST00000366997 7782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC002550.1-201ENST00000565916 1379 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FMR1-220ENST00000621987 1352 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AR-202ENST00000396043 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 USP3-213ENST00000559711 1693 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 AC011458.2-201ENST00000603937 207 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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