Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRELID3BQ9Y3B1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRELID3BQ9Y3B1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms