Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN6Q9UQ52 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms