Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AP4E1Q9UPM8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP4E1Q9UPM8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms