Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZMYND8Q9ULU4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZMYND8Q9ULU4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZMYND8Q9ULU4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms