Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC42EP3Q9UKI2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDC42EP3Q9UKI2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms