Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DCTN4Q9UJW0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DCTN4Q9UJW0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DCTN4Q9UJW0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms