Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMPXQ9UHP9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMPXQ9UHP9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms