Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TMEM106BQ9NUM4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TMEM106BQ9NUM4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms