Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNIP2Q9NS61 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNIP2Q9NS61 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms