Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRMS1Q9HCU9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRMS1Q9HCU9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRMS1Q9HCU9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms