Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MED28Q9H204 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms