Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC27Q9C0I9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC27Q9C0I9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC27Q9C0I9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
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