Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM5Q9C035 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms