Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAIPQ9BWF2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAIPQ9BWF2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms