Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTDSS2Q9BVG9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTDSS2Q9BVG9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms