Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NDUFAF3Q9BU61 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms