Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C2orf88Q9BSF0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C2orf88Q9BSF0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms