Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TUBA1CQ9BQE3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TUBA1CQ9BQE3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms